1 物理清除法： 简单的说就是拿刷子去刷，市面上卖的磁铁刷，鱼缸刷都很好用，同时换水，效果极佳。缺点是麻烦，角落等地方不易清除，缸子大的话更是大工程。

2 化学清除法： 使用除藻剂，效果普通，优点是对任何藻类都有效，且可有效清除附着在水草、沉木等不易清除地方的藻类。缺点是依据品质不同对鱼和生态平衡有一定程度的冲击。

3 生物清除法〔最佳方式〕： 使用除藻动物（如：笠螺，.白玉飞狐，琵琶鼠、黄金琵琶鼠，黑壳虾，大和藻虾）来控制藻类的数量，效果为三种中所花费时间较长，但最安全也最省力的方式。