结局没有在一起。在电影《穿越时空的少女》的结局中，间宫千昭最后穿越回到了未来，在临走前和绀野真琴约定好，自己会在未来等她，而绀野真琴也表示自己有一天一定会去往千昭的时代。电影的结局是不完美的，男女主角最终没有走到一起，毕竟它们来自不同的时空。