cp -r  的作用是递归，可复制目录，如果复制目录必须加此选项。

cp -R 的作用仅仅是复制目录。

不过cp -r 和-R命令功能上是等价的。不加-r或者－R的时候，只输入命令cp时只拷贝文件，不拷贝文件夹，加上后则会拷贝文件夹——包括下一级的子文件夹，以及子文件夹中的子文件夹，以此类推。

cp -a作用为归档复制，常用于备份，相当于cp -dr --preserve=all。