原因是分子兽和悟空兽素来不和，所以他想复制素娜，并利用她的爱心徽章来令比丘兽进化，以此报复悟空兽，两者在游戏中是有相互攻击有性的。

分子兽和悟空兽有什么恩怨

在倒金字塔的战斗中，分子兽设计将悟空兽吸入黑色电缆互相缠绕形成的线球中，在强烈的电击和电缆的缠绕下悟空兽在哀嚎中消失。