工作原理不同：巴氏杀菌是加热至68～70℃，并保持此温度30min后急速冷却4-5℃高温杀菌加热温度为135-150℃、加热时间2-8s、产品达到商业无菌要求。
使用设备不同：巴氏设备为巴氏杀菌机高温杀菌设备为蒸汽或热交换器。
保存时间不同：巴氏杀菌消毒后，要在4℃左右温度下保存，且保存时间为3~10天超高温杀菌杀菌后，在无菌环境中包装，可最大限度保存产品营养和风味。
巴氏消毒和高温灭菌的区别
巴氏杀菌是使用相对比较低的温度对食品进行加热，这样能够起到一定杀菌效果。高温杀菌是使用高温或者是高压的方式进行杀菌。巴氏杀菌叫做电加热，高温杀菌叫做蒸汽加热，两者都可以起到一定杀菌作用，但是杀菌过程是不一样的。
