冬瓜栽培中是最忌淹水，洪水浸过的冬瓜易烂苗。虽然冬瓜的生长，特别是果实的生长期是需要水分较多，但其根系生长也较浅，不耐涝，如果土壤淹水达40个小时，会引起植株死亡。水淹后植株有出现枯萎，还有出现烂茎的现象，建议用根腐消生物杀菌剂500倍对叶片喷雾及灌根，株灌药液约250毫升然后再向叶茎喷一次0.04ppm芸苔素内酯。

目的是利用根腐消进行对枯萎、疫病、黑胫、炭疽等多种真菌性病害进行防治。