二者的区别是两个不一样的机构。爱卫办即爱国卫生运动委员会办公室，主要负责指导群众开展卫生清洁活动，组织群众开展灭鼠，开展环境卫生整治、农村饮用水和厕所改造等工作。而文明办的全称是精神文明建设指导委员会办公室，属于当地党委部门，隶属于各地党委宣传部，负责精神文明建设及文明城市创建工作。