杨宪因为自己性格以及为人处世的问题最后被朱元璋杀死。根据史料记载，杨宪在进入中书省之后，如同变了一个人，异常的嚣张跋扈。

加之和李善长、胡惟庸的明争暗斗，惹得朱元璋大为恼怒，最后杨宪升任中书省左丞的当月，杨宪就被朱元璋除掉了。