企业配置党建指导员的目的是发现企业党建工作的问题，改进党建工作的方法，从而督促和强化企业党的建设，推动企业经济发展。配备党建指导员这一举措，对于强化企业党建引领作用，推动领导班子政治思想和作风建设，带动企业经济建设发展，具有重要的意义。