增值税专用发票跨季隔月是不能作废的，开票系统不允许，所谓跨月跨季的作废，只能申请开红字发票，用以对冲以示作废。

开了红字的专用发票，进入税务申报系统一样，按开票系统的月汇总表上的数字一一按样填写申报表，若有负数（即红字），照样填上负数，点击发送即可。