商铺产权证和住宅产权证是差不多的，主要的差异就是在土地使用年限与产权性质，商铺房产证在办理和转让过程中的税费相对较高，具体高多少看当地政策。

还有一个比较大的区别，就是商铺的土地使用年限较普通住宅有较大的差距。原则上，普通住宅是70年，商铺使用年限是40年，其他方面均相同。