距离北京南站较近的博物馆有北京古代建筑博物馆和北京自然博物馆。

北京古代建筑博物馆位于西城东经路21号，从南站坐公交3站半小时就可以到达。

北京自然博物馆位于天桥南大街126号，坐地铁20分钟就可以到达。

这两个博物馆都是周一闭馆，需要提前预约。