氢离子只有原子核，没有核外电子。氢离子的结构示意图用圆圈表示氢原子核，核内有一个质子，带一个单位负电荷，所以在圆圈内写+1。

氢离子是氢原子失去一个电子形成的阳离子，带一个单位正电荷，其符号为H⁺。

某些情况下，也能形成带一个单位负电荷的阴离子，称为氢负离子:H⁻。氢的核素氕形成的阳离子可以看作质子。但另外两种核素氘和氚形成的阳离子则不能看作质子，只能叫做氢离子。