肯定有影响。

主法官被调查，首先你的案子得暂停审理。若主法官翻车与你的案子无关，法院会重新安排人组成新的合议庭，合议庭熟悉案情后就会适时开庭审理。若主法官就是因为你的案子被调查，那就得先纪律调查处理结束了才能再审理案子了。