晚上温度为5度左右，昼夜温差大，湖泊面积458k㎡，湖泊补给系数为3.1左右，是中国西北内陆湖泊中补给系数最小的一个流域。赛里木湖最大水深92m，平均水深46.4m，储水量约2.1×1010m3。湖区四周群山环绕，并有冰川存在，构成封闭的高山盆地水系。