阿妹--------通常是指：亲妹。

呀妹-------广州话里包括有：亲妹、结拜兄妹、唐妹、表妹等待。

香港地区除了讲白话的还有讲客家话的，和潮汕话的，根据你的提问，我估计是你听到了客家话有人叫小孩叫阿妹，其实就是对小孩的一种爱称，就跟普通话里的宝贝差不多。