区别就是两者所表达的中文意思是不一样，具体的不同如下

harmony在横向和纵向上相对更关注纵向上的规则

counterpoint相对更关注横向上的规则。

说得更通俗一点，harmony关注的是三度结构的和弦的使用方法和之间的连接的规则和逻辑，counterpoint关注的是在保证纵向和声符合规则的情况下的每个声部横向上的运行。