两个词语之间的区别在于：

代号，为了简便或保密而用来代表的符号，常用于人称、事物或通讯事业中。

例句：他有些无意识地念着这个名字，从前只不过是一个人的寻常～，可是此时念起来，每一个音调，带起微微的气流，都仿佛缓慢震荡起来什么。

别名，同义词：别称法定名符或规范的名称以外的名称，一种人、事、物、业在官方法定的名称之外还有另外的一种名称，或同是用之于书面，或同是用之于口语，有地方称之为昵称、花名等。