《量子江湖》的故事发生在架空的历史背景下，冷兵器时代的生产力，叠加上极富现代气息的武学校园和世俗世界，被认为最好地将传统武侠的古道西风、侠骨柔肠和现代社会的缤纷多姿、科学理性结合在了一起。

整部小说的故事主要由以下四条主线构成：武学崛起、两部奇书、时代背景以及情感线索。