工程档案应该由当地的档案局主持验收，因为当地的档案局是档案管理工作的行政部门，负责当地的档案管理工作的监督检查和验收工作，工程档案是工程项目建设的原始资料，完整记录着整个工程项目建设的规模，设计以及建设要求等专业档案。