公司财务制度没有去税务局备案会被罚款。

从事生产、经营的纳税人应当自领取税务登记证件之日起15日内，将其财务、会计制度或者财务、会计处理办法报送主管税务机关备案。否则，由税务机关责令限期改正，可以处二千元以下的罚款情节严重的，处二千元以上一万元以下的罚款。