菩提祖师厉害。菩提祖师和张三丰都是道教里的宗师级别人物。不同的是菩提祖师是神话小说西游记里的人物，培养了如孙悟空之类的杰出徒弟，能够会孙悟空所有的神通以及其他本领。

而张三丰是历史上存在过的人物，在武当武功名气传扬过程和太极文化诞生中起到了重要作用。但如果单说两者实力，自然是菩提祖师更厉害。