RNA一般为单链，不存在氢键，但双链的由于碱基互补配对存在氢键。RNA虽然是单链，但是局部可以自我形成双链，在RNA内部形成氢键。不是所有RNA都可以形成双链，需要内部有反向互补序列才可以。RNA和DNA一样，也是由各种核苷酸通过3′，5′-磷酸二酯键连接构成的多核苷酸链，但与DNA有一系列差异。