农产品核定扣除备案每年都要做的。

每年都需要提交一次。农产品核定扣除在纳税人购进农产品直接销售、购进农产品用于生产经营且不构成货物实体时，应在申报缴纳税款时向主管税务机关备案。是有强制性备案要求的，还要提供相关材料。

有关农产品增值税进项税额扣除标准备案：

纳入农产品增值税进项税额核定扣除试点范围的纳税人，购进农产品直接销售、购进农产品用于生产经营且不构成货物实体扣除标准的核定采取备案制。