GEPIA数据库具有84种癌症亚型，从基因水平扩展到转录本水平将基因表达量化，支持对特定癌症亚型的分析和亚型之间的比较。

此外，GEPIA采用了受单细胞测序研究启发的新的基因特征量化分析技术，提供定制分析，用户可以上传自己的RNA-seq数据，并与TCGA和GTEx样本进行比较。还提供了一个用于批量处理的API，以及容易检索分析结果。