圣女果畸形果的原因是氮、磷肥用量过多，但硼、钙用量较少时，容易产生多中心随机果。冬季或早春栽培的圣女果在花芽分化前后遇到6~8的低温数天就会出现畸形果。畸形果主要是由于花芽分化前呼吸消耗的营养物质减少，从叶片到花的营养物质转运增加，使花内碳水化合物积累，造成心皮多，畸形果。另外，用浓度过高的激素处理时，或温度低、光线不足、空气干燥、或营养条件差时，对应该脱落的花用激素处理，抑制脱落，勉强持果，但得到的光合产物少，形成畸形果。