校长酒驾不予起诉，但不一定会撤销校长职务。

校长酒驾被公安机关查处，情节较较，且没有对社会造成严重危害，所以公诉机关做出了不予起诉裁决，只是校长不用负法律责任，但是还是要负行政责任的，而行政处罚又有多种，根据责任大小来对应处罚，所以不一定是撤职。