原因是很多地方医疗保险的个人账户实行“年度预付”和“年度清算”，也就是到了每年的4月1日零点，会按照规则比例或者金额，先把本结算年度所有医疗保险个人账户的金额，一次性地划入你的医保个人账户卡上。

同时，又根据上年度结算的实际情况，进行转入和转出，也就是对预先计入个人账户的金额到第二年要进行清算结转等手续。

部分参保人员如果在这一年中办理了退休，就出现了预先给你打入账户的钱高于实际本应该给你打的钱，而你之前的钱又已经全部用完了，这就造成年度清算的时候出现了负数。