大众途悦空调系统和其他车型一样，挺好的。它提供了CLEANAIR空气净化功能，可以有效去除车内PM2.5颗粒。双区自动恒温三旋钮操作风格，可以属于大众典型的设计风格，操作简单，逻辑清晰。顶车还有座椅加热功能。车辆尾部还配有独立的空调出风口，可以控制风量，但不能控制温度。