要看撞机事故的大小才能确定企业是否会起诉。如果仅是一般的事故，撞坏的设备或工件价值不高，损失不大，企业可能不予追究，但设备及产品的经济价值较大造成的损失惨重，企业有可能通过法律途经追索赔偿。但无论如何，当事人发生设备操作事故后，不辞而别的做法是错误的，不可取的。所以不管是否被起诉都不可以擅自离职。