遮天中的南妖兄妹的结局是和天庭众人一起进入了仙域成为了仙人，南妖齐麟兄妹是非常强大的存在，他们和叶凡是不打不相识的关系，在叶凡成就了天帝后他们兄妹就选择了自我封印，在叶凡打开成仙路后，南妖兄妹跟随叶凡一起进入了仙域成为了仙人，结局圆满。