一般来说，制度集成创新具有融合性、系统性的特点，有利于优化配置制度创新资源要素、促进创新主体有效合作，形成集成放大效应。一方面，制度集成创新能够提高效率、激发活力。对企业而言，制度集成创新有利于降低制度型成本，提高办事效率。对市场而言，制度集成创新有利于改善营商环境，激发市场活力。
另一方面，制度集成创新能够显著提升发展动能。制度集成创新有利于加速新兴产业和现代服务业等高端要素聚集，有力支撑经济结构优化升级。此外，制度集成创新还有利于推动区域经济平衡发展。制度集成创新是创新主体协同发展、相互作用，共同创造新业态、新模式的过程。
例如，在制度集成创新的推动下，以一体化建设为抓手，能够确保片区之间资源共享、优势互补，形成区域经济一体化发展联动链。系统集成后的制度创新能够加速营商环境不断优化，使得区域吸引力持续增强、优势资源加速集聚、经济发展新引擎不断涌现。
进一步加强制度集成创新，应把握好几个关键点。一是用系统化思维谋划顶层设计。顶层设计是制度集成创新的关键所在。系统集成要兼顾整体性和重点性，用系统化思维进行顶层设计时要关注整体效益，建立广泛参与的管理工作架构，设计相互补充的制度体系。
二是夯实制度集成创新的基础条件。可以说，在制度集成创新的过程中，试验任务和创新举措是基石。要做好系统集成工作，首先要做细做实基础工作，即切实落实试验任务和创新举措。
