它们的区别是读音和意思不同。

1、真菌，读音zhēn jūn ，意思是生物界中的一大类，组成真菌门的成员。

2、黏菌：读音nián jūn，意思是一种类似霉菌的生物，会形成具有细胞壁的孢子，但是生活史中没有菌丝的出现，而有一段黏黏的时期，因而得名。