鸳鸯可从体色区分雌雄，雄性鸳鸯的体色比较鲜艳，雌性鸳鸯的体色比较暗淡。也可从头型区分，雄性的头型是背头，头部比较尖，比较小雌性鸳鸯的头部比较扁平，头部较圆，头部比较大。

还可以从泄殖腔区分，雄性鸳鸯的泄殖腔的殖骨间距较小，并且有兴状突起雌性鸳鸯的泄殖腔的殖骨间距较大。