1、科属不同

柏子香是松科雪松属植物而柏木香是柏科柏木属植物。

2、分布范围不同

柏子香主要分布在四川、湖南、湖北、重庆等地而柏木香主要分布在长江流域及以南地区，垂直分布主要在海拔300-1000米之间。

3、从属关系不同

柏木香分为普通柏木、黄柏木、香柏木柏子香是柏木的一种。