妹妹的女儿应该是旁系亲属才对，不是直系亲属，直系亲属，是指相互之间有一脉相承的血缘关系的上下各代亲属，如父母与子女、外祖父与外孙子女等。

但属于旁系三代以内亲属，法律上不允许通婚。如果偷偷结婚，被查到是要罚款或追究责任的。