马芬蛋糕与普通蛋糕的区别是柔软细腻度不同。普通蛋糕是先将蛋白打发成泡沫，然后混合蛋黄糊烘烤，口感细腻柔软。马芬蛋糕是全蛋打发，效果比不上普通蛋糕蓬松，口感比普通蛋糕要硬一点点。所以马芬蛋糕与普通蛋糕的区别主要是柔软细腻程度不同。