会影响。

你的微信在别人的手机登录，你的行程卡信息就会随别人的手机的行程产生记录。而这个记录实际上是别人的行程轨迹，而不是您的行程轨迹。要是别人去公共场所打卡了，会在您的行程记录里，而您本人实际上没有经过那个区域。因此，您的微信如果在别人的手机登录了，您的行程轨迹不能反映真实情况。