温实初被陷害是在第63集，滴血验亲那一日，祺嫔诬陷两个孩子是甄嬛和温实初的私生子，“温太医，你敢说你就没皇上的女人有过情”祺嫔剜心之语，意指甄嬛。温实初其实通过滴血验亲的方式已经证明了甄嬛的无辜，说明他和这件事就没关系了，那为什么还要自宫呢

唯一能让人理解的是为了沈眉庄，当时眉姐姐已经怀了他的孩子，并且马上就要临盆，温实初看到并亲身经历了甄嬛遭受的凌辱，她们两个人性格大相径庭，他害怕这一切还会发生在眉姐姐身上。