1、先找着该基因的mRNA序列，然后再根据此找其DNA序列，都找到后，相对应mRNA序列ATCG之前的2000个DNA碱基序列即为启动子区域。如果没有自动将之区分显示出来的网站或工具，我们可能的方法就是将mRNA和DNA进行手动比对

2、找到了该启动子区域后，下一步要做的就是对该区域进行反式转录因子结合部位，也就是顺式作用元件就行分析。