被日本人开枪打死了。

菊花是为了救她儿子而死的。在跳墙逃跑过程中，她的腹部中了一枪，后来到了三块堂后由于止不住流血，文三块也不会取子弹，最后就死了。菊花，性格泼辣的北京大妞，是一名敢爱敢恨的奇女子，不仅敢于冲破当时的封建思想，追求自己爱慕的文三块，更是在医术上处处帮助他，两人真心相爱，喜结连理。可之后两人关系总被人压制拆散，最终不得不分开。