朱棣以罪人的身份处理靖难遗孤，并将他们列为罪臣之后。

历史上，朱棣没有赦免靖难遗孤，因为朱棣是造反夺得的皇位，他本是一个藩王，驻守在北平，朱元璋先立的太子是朱棣的大哥朱标，朱标死后，又立了皇太孙朱允炆，朱元璋死后朱允炆当了皇帝，由于朱允炆过早的消掉藩王的权利，使朱棣造反，造反的名义是清君侧，其实就是朱棣自己想当皇帝，如果朱棣赦免了靖难遗孤，就更加证明了他是篡位夺得的皇帝，所以朱棣是不会赦免靖难遗孤的。