静默管理和非法限制自由的不同之处在于静默管理指的是实施静态的管理方式，也就是说限制人员流动的管理方式。

静默管理一般由政府相关部门下达的，符合法律法规。

非法限制自由指的是以非法的方式来限制他人的自由，也就是说通过不合法的方式来限制他人的自由。

非法限制自由不受法律保护，而且也是法律不允许的。