滤膜从内到外有三层结构：内层为内皮细胞层(厚约40nm)，为附着在肾小球基底膜内的扁平细胞，上有无数孔径大小不等的小孔，小孔有一层极薄的隔膜中层为肾小球基膜(厚约240-370nm)，电镜下从内到外分为三层，即内疏松层、致密层及外疏松层，为控制滤过分子大小的主要部分，是机械屏障的主要部分。