母差保护和断路器失灵保护在保护原理上是有很大区别的。

母差保护动作的原因是由于母线上有短路故障，母差保护动作跳开接在该母线上的所有断路器，以切断故障点。

断路器失灵保护则是由于，连接在母线上的某一个断路器因为线路或电气设备故障，本来应该跳开该线路断路器。但是因为该断路器故障无法正常跳闸（即跳闸失灵），断路器失灵保护动作，跳开连接在母线上的所有断路器。