萧平旌恨林奚的原因是:林奚在自己大哥都中了瘟疫的情况下，选择救了自己，最终导致了大哥身中剧毒，最终死在了前线战场上，这也是萧平旌非常的恨自己和林奚，他责怪林奚没有救大哥萧平章，而救了自己这个远离朝堂的人，这也是一个非常无奈的选择。