微波炉内的水箱是为了使用蒸汽功能的时候而设置的，可以使食品加热后不易发干发硬，有类似蒸汽加热的效果，使用前一定要确定里面有加足够的水量。

另外也可以起到蒸汽清洁的作用，只要把醋或柠檬酸和水混合放入水箱里然后选择功能就可以进行消毒、清洁。由于微波炉水箱的安装槽被固定在箱体内，且既深又窄，往往难以清洗。