一、释义不同

专从事某一项事的人才或学问。

专程：专门为某事到某地。

二、词性不同

专门：形容词

专程：副词

三、出处不同

专门：唐 玄奘 《大唐西域记·印度总述》：“部执峰峙，诤论波涛，异学专门，殊途同致”。

专程：曹靖华 《飞花集·小米加步枪》：“一九三三年，我回国后，在该年底，利用寒假，专程由 京 赴 沪 ，去探望阔别已久，怀念殷切的 鲁迅 先生。”