团藏让院长杀兜是为了让他们自相残杀，这样就可以让兜黑化，从而报复木叶村，这样团藏就可以以三代目火影管理村子不力，逼迫三代火影退位，从而让自己成为新的火影忍者可以说团藏为了成为火影已经是不择手段，甚至利用兜和养大他的院长。