因为洋葱鳞片内表皮细胞没有紫色色素，在显微镜下是无色的，一般用于染色观察DNA和RNA的分布情况（DNA和RNA的颜色只是指示剂的颜色）。

而洋葱鳞片外表皮细胞液泡中有紫色的色素，所以呈紫色，常用来做质壁分离及复原实验。

紫色洋葱鳞片叶外表皮是有颜色的，内表皮是没有颜色的。所以紫色洋葱鳞片叶可以用来做质壁分离与复原的实验，而内表皮可以做观察DNA和RNA在细胞中的分布的实验。